北京國際馬拉松賽11月25日鳴槍，大約3萬名選手在零度以下的嚴寒天氣中展開了角逐。日本媒體有報道稱，受中日關系惡化影響，日本選手“曾一度無法報名參加本次比賽”，后來主辦方改變了做法，并出于安全考慮采取一定措施，讓日本選手受“特殊照顧”。
日本共同社11月25日報道稱，在受到來自日本政府和中國國內的“批評”后，主辦賽事的中國田徑協會改變了拒絕日本選手報名的做法。在當天的比賽中，有的日本選手身著了印有中日國民交流友好年標記的文化衫。
報道透露稱，賽事主辦方以中日關系處于緊張狀態、出于安全考慮為由，為日本參賽者單獨劃出了的集合地，并使用大巴將他們送至起跑點。
一名參賽的日本女性表示：“沿途受到聲援，跑得相當愉快。我對邊跑邊打出標語的中國人也喊了‘加油’，對方都報以笑容。”
針對日本媒體關于“北京馬拉松拒絕日本人參賽”的報道，國家體育總局田管中心副主任、中國田徑協會副主席沈純德已于11月11日作出正面回應表示否定，并介紹說：“按照去年報名的情況，日本國籍的馬拉松愛好者通過網絡進行個人報名的情況極為個別，基本都是通過日本企業等途徑進行的團體報名。我們今年仍然是按照去年的方式接受日本馬拉松愛好者的團體報名，因為這樣便于日本參賽選手之間互相照顧，在領取參賽號碼和服裝等方面也便于操作，因此北京馬拉松的官方網站沒有開放對日本愛好者的個人報名。”
沈純德進而表示：“我們也注意到了日本媒體的報道，既然日本馬拉松愛好者如此踴躍的愿意通過個人報名的方式來參賽，那么我們就開放個人報名渠道給他們!北京馬拉松永遠以開放的姿態歡迎世界各地的愛好者前來參賽、感受開放的北京、感受開放的中國。”